<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Nova Biologica Reperta</title>
<title_fa>یافته‌‌های نوین در علوم زیستی</title_fa>
<short_title>NBR</short_title>
<subject>Basic Sciences</subject>
<web_url>http://nbr.khu.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2423-6330</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2476-7115</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.22034/nbr</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1398</year>
	<month>2</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2019</year>
	<month>5</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>6</volume>
<number>1</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>توالی­ یابی ژن راستی ­سیانین  قبل و بعد از جهش با دی اتیل سولفات در باکتری اسیدیتیوباسیلوس اس پی. FJ2
</title_fa>
	<title>Sequencing of the rus gene before and after the mutation with DES in the bacterial Acidithiobacillus sp. FJ2</title>
	<subject_fa>میکروبیولوژی</subject_fa>
	<subject>Microbiology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;در باکتری اسیدیتیوباسیلوس فرواکسیدانس، پروتئین&amp;shy; های موجود در مسیر زنجیره انتقال الکترون از جمله پروتئین راستی&amp;shy; سیانین، با اکسیداسیون آهن فرو به فریک، سبب آزادشدن الکترون و در نهایت استحصال اورانیوم می&amp;shy; شوند. تاکنون، ارتباط بین توالی این ژن با میزان استخراج اورانیوم در فرایند بیولیچینگ بررسی نشده است. بنابراین، در این مطالعه پس از تغییر میزان استحصال اورانیوم بر اثر جهش باکتری، بررسی تغییرات ژن &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;rus&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;، می&amp;shy;تواند نقش مستقیم و دقیق این پروتئین را آشکار سازد. بدین منظور، در باکتری اسیدیتیوباسیلوس اس پی. &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;FJ2&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; بومی با دو دوز %8/0 و %1 از دی اتیل سولفات جهش تصادفی ایجاد شد. سپس، جهت انجام فرایند بیولیچینگ، باکتری&amp;shy; ها به محیط حاوی %50 سنگ معدن اورانیوم منتقل شدند. بعد از اندازه &amp;shy;گیری میزان استخراج اورانیوم، آهن، میزان تغییرات اکسیداسیون و احیا و &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;pH&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; در فرایند بیولیچینگ، به&amp;shy; منظور بررسی سکانس ژن راستی &amp;shy;سیانین، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;DNA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; ژنومی استخراج و پس از انجام &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;، برای تعیین توالی فرستاده شد. سپس، با استفاده از نرم &amp;shy;افزار &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;Bioedit v7.2.5&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;، سکانس ژن وحشی با موتانت تحت مقایسه قرار گرفت. نتایج نشان داد که استخراج اورانیوم توسط باکتری جهش&amp;shy; یافته با&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;%1 &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;DES&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; بین روزهای 11-7 نسبت به باکتری وحشی افزایش یافته است. با این وجود، تغییری در نواحی عمل&amp;shy; کردی ژن راستی&amp;shy; سیانین رخ نداده است. به&amp;shy; نظر می رسد که احتمالاً، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;DES&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; اثر خود را بر دیگر ژن&amp;shy; های مؤثر در زنجیره انتقال الکترون و یا در نواحی تنظیمی گذاشته است که نیازمند مطالعات بیشتر در این زمینه است.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;
&amp;nbsp;&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
&amp;nbsp;</abstract_fa>
	<abstract>In &lt;em&gt;Acidithiobacillus ferrooxidans&lt;/em&gt;, the proteins present in the electron transfer pathway cause ferrous iron oxidation which leads to uranium extraction. The relationship between gene sequence and uranium extraction has not been investigated yet. Based on the changes in uranium extraction, the changes of rus gene sequence can reveal the direct and accurate role of this protein. For this purpose, a random mutation was induced in native &lt;em&gt;Acidithiobacillus &lt;/em&gt;sp. FJ2 by two doses of 0.8% and 1% of DES. Then, the bacteria was transferred into a medium which contained 50% uranium ore to carry out the bioleaching process. After measuring the amount of the extracted uranium, iron, Eh and pH, genomic DNA was extracted to investigate the rusticyanin gene (rus) sequence sent for sequencing after performing PCR. Then, the wild-type gene sequence was compared with the mutant by Bioedit v7.2.5 software. The results showed that uranium extraction increased by mutant bacteria with DES 1% between 7-11 days in comparison with wild bacteria. However, there has been no change in the functional areas of the rusticyanin gene. It seems that DES affected other effective genes in the electron transport chain or regulatory areas, which required further studies.&lt;br /&gt;
&amp;nbsp;&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
&amp;nbsp;</abstract>
	<keyword_fa>انتقال الکترون, بیولیچینگ, پروتئین, جهش تصادفی, میکروارگانیسم</keyword_fa>
	<keyword>bioleaching, electron transport, microorganism, protein, random mutation </keyword>
	<start_page>50</start_page>
	<end_page>60</end_page>
	<web_url>http://nbr.khu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-114-2&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Somayeh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Farahmand</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سمیه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>فرهمند</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>S.farahmand@pnu.ac.ir</email>
	<code>10031947532846006521</code>
	<orcid>10031947532846006521</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>payame noor University</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه پیام نور</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Faezeh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Fatemi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>فائزه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>فاطمی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email> ffatemi@aeoi.org.ir</email>
	<code>10031947532846006522</code>
	<orcid>10031947532846006522</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>NSTRI</affiliation>
	<affiliation_fa>سازمان انرژی اتمی ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Reza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Hajihosseini</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>رضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>حاجی حسینی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>hosseini@pnu.ac.ir</email>
	<code>10031947532846006523</code>
	<orcid>10031947532846006523</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>payame noor University</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه پیام نور</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
